An das Dekanat Regensburg sind Dienste angegliedert wie die Evangelische Jugend (EJ), die Evangelische Jugend Sozialarbeit (EJSA), die Evangelische Studierendengemeinde (ESG) und die Klinikseelsorge. Sie sind alle unselbstständig.
Die ejsa Regensburg ist ein Arbeitsbereich des Evangelisch-lutherischen Dekanatsbezirks. Als Träger der freien Jugendhilfe fördert sie Kinder, Jugendliche und Familien in der Region.
Die Evangelische Studierenden- und Hochschulseelsorge vertritt die Evangelische Kirche an Hochschulen im Dekanat in Regensburg, Straubing und Deggendorf.
Im Dekanat Regensburg werden 13 Krankenhäuser von hauptamtlich Seelsorgenden betreut. Dies geschieht in ökumenischer Zusammenarbeit, sodass die Seelsorge in den Häusern möglichst präsent sein kann.